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行業(yè)聚焦:突破小核酸藥物初篩低效困局

2023-05-06 2000







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引言

introduction


2023年3月7日,阿斯利康制藥與Ionis公司的ASO類型藥物“Eplontersen”在國內(nèi)申請上市,用于治療遺傳性轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白淀粉樣變性。該藥于2022年初由美國食品和藥物管理局(FDA)已授予孤兒藥資格(ODD)。




小核酸藥物類型及發(fā)展現(xiàn)狀

Types and Development Status of Small Nucleic Acid Drugs






自從1961年mRNA的發(fā)現(xiàn)開始,到ASO、適配體、RNAi、遞送系統(tǒng),小核酸藥物一步步從想象走入現(xiàn)實,隱隱成為繼小分子藥物、抗體藥物外的第三大類藥物,引領(lǐng)新一輪的制藥浪潮。


小核酸藥物,即寡核苷酸藥物,是由十幾個到幾十個核苷酸串聯(lián)組成的短鏈核酸,作用于pre-mRNA或mRNA,通過干預(yù)靶標(biāo)基因表達(dá)實現(xiàn)疾病治療目的。主要包括 RNAi 藥物(siRNA、miRNA)和 反義核苷酸(ASO) 藥物,另外還有核酸適配體及其他短RNA片段類型(saRNA、sgRNA、tRNA碎片等)。




Advantage

基于其靶向針對pre-mRNA或mRNA的特性,小核苷酸藥物可于RNA水平上實現(xiàn)對疾病的治療,可選成藥靶點更多,具有以下多重優(yōu)勢:

小核酸藥物2



起初,小核酸藥物的發(fā)展瓶頸在于如何避免受體體內(nèi)核酸酶的降解,成功進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部調(diào)節(jié)RNA表達(dá)水平或蛋白翻譯過程。隨著化學(xué)修飾技術(shù)的突破和GalNac遞送系統(tǒng)的出現(xiàn),初步解決了小核酸藥物的不穩(wěn)定性和缺乏有效遞送系統(tǒng)的問題。小核酸藥物基于疾病靶點基因序列的主動式、數(shù)字化設(shè)計、合成模式,極大地縮短了傳統(tǒng)藥物無法避免的篩選周期。全球相關(guān)市場規(guī)模自2016年起迅速增大,已由最初1千萬多美元增長至2022年的37.84億美元,近三年年均增長率12%以上,成為全球藥物研發(fā)領(lǐng)域的最前沿。



數(shù)據(jù)圖


全球小核酸藥物市場規(guī)模統(tǒng)計(2016-2022,單位:億美元)




小核酸藥物研發(fā)關(guān)鍵問題及挑戰(zhàn)

Key issues and challenges in the development of small nucleic acid drugs






小核酸藥物研發(fā)過程中的不同問題需要相應(yīng)的技術(shù)加以解決。按照小核酸藥物研發(fā)流程,核心技術(shù)分為RNA設(shè)計、化學(xué)修飾、遞送、合成及制劑技術(shù)。其中最首要的核心技術(shù)在于高效準(zhǔn)確地獲得具有效的、特異性作用分子序列;最關(guān)鍵的核心技術(shù)是小核酸藥物遞送技術(shù),增強(qiáng)分子穩(wěn)定性和靶向能力、降低給藥劑量和毒副作用。


在大量資本進(jìn)入小核酸藥物研發(fā)行業(yè)的現(xiàn)狀下,鑒于靶點基因序列的多樣性與復(fù)雜性,如何快速準(zhǔn)確篩選到具備藥效價值的核酸片段就成為研發(fā)初始的首要任務(wù)。小核酸藥物的靶向目標(biāo)在于細(xì)胞內(nèi)特異性RNA片段,因此對其表達(dá)水平的上調(diào)或下調(diào)存在顯著影響是藥物有效性篩選的重要指標(biāo)。


對于細(xì)胞基因表達(dá)水平上調(diào)或下調(diào)的傳統(tǒng)研究方式,需要在給藥處理后繼續(xù)培養(yǎng)細(xì)胞達(dá)到一定數(shù)量級,收集細(xì)胞并純化RNA,再通過熒光定量PCR獲得CT值進(jìn)行分析比較。該過程受限于RNA純化方法及通量限制,在細(xì)胞培養(yǎng)、核酸提取過程耗費大量時間、人力、資金,無法快速高效地獲得數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。同時由于實驗環(huán)節(jié)相對較多,數(shù)據(jù)均一性、穩(wěn)定性無法達(dá)到精準(zhǔn)化篩選要求。




Foregene

福際生物基于直接PCR/qPCR技術(shù)平臺,帶來創(chuàng)新性高效”5H”篩選解決方案——Cell Direct RT-qPCR kit,可于培養(yǎng)板原位處理細(xì)胞獲得RNA模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,節(jié)省大量操作及時間,并可適配自動化,高效準(zhǔn)確獲得細(xì)胞GOI表達(dá)水平結(jié)果,迅速確定具備藥效價值的核酸片段!


H1

H1-高效率High Efficiency:7分鐘即可完成整板RNA模板制備(5mins裂解+2mins終止),無需大型儀器??墒褂枚嗫顧C(jī)型的FAST擴(kuò)增程序,最快可在90分鐘內(nèi)完成篩選全流程,比傳統(tǒng)方法節(jié)約80%時間!


1圖

5min板孔原位裂解釋放RNA, 2min終止反應(yīng)

所得裂解液即可作為模板進(jìn)行后續(xù)RT-qPCR反應(yīng)


H2

H2-高精密度High Precision:可實現(xiàn)全自動化操作,整板均一性好,相對傳統(tǒng)方法精密度數(shù)量級提升。


2圖

整板CT值均一性好


H3

H3 -高通量High Throughput:最大可一次性進(jìn)行384孔基因表達(dá)篩選,相對傳統(tǒng)方法提升4倍以上。

細(xì)胞直接RT-qpcr圖2

藥物處理后384孔細(xì)胞基因表達(dá)差異的擴(kuò)增曲線


H4

H4-高適應(yīng)性High adaptability:適用于懸浮細(xì)胞與貼壁細(xì)胞擴(kuò)增篩選,同時適用于超過10種常用細(xì)胞類型。試劑盒具有很低的檢測下限,10 - 106個細(xì)胞級別均能夠?qū)崿F(xiàn)準(zhǔn)確擴(kuò)增。

a1ddf027153c8fc91fe7f40ce0c3443

H1299細(xì)胞1E5數(shù)量級別,10倍梯度稀釋后CT值及擴(kuò)增曲線

檢測位點:Actin 60


H5

H5-高準(zhǔn)確度High Accuracy:可使用UDG防污染體系;同時RT-qPCR反應(yīng)酶抑制物耐受性極強(qiáng),可以無視培養(yǎng)基殘留干擾,讓篩選結(jié)果更可靠。


小分子藥物靶向推文圖3


RT-qPCR反應(yīng)抑制物耐受性,培養(yǎng)基殘留干擾對比


FG

訂購信息

貨號

規(guī)格

產(chǎn)品名稱

DRT-01011

DRT-01012

200T

1000T

QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- SYBR Green I

DRT-01021

DRT-01022

200T

1000T

QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

-Taqman

DRT-02121

400 T

(384-well) QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- Taqman

DRT-02011

96T

(96-well) QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- SYBR Green I

DRT-02021

96T

(96-well) QuickEasy?

Cell Direct RT-qPCR Kit

- Taqman




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